MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 chromosome

Total Repeats: 42389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016805	CTT	2	6	6	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016805	GTC	2	6	25	30	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016805	TCATT	2	10	75	84	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016805	GA	3	6	105	110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016805	AGA	2	6	136	141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335654
6	NC_016805	T	6	6	167	172	0 %	100 %	0 %	0 %	381335654
7	NC_016805	TA	3	6	203	208	50 %	50 %	0 %	0 %	381335654
8	NC_016805	TTA	2	6	351	356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335654
9	NC_016805	CG	3	6	426	431	0 %	0 %	50 %	50 %	381335654
10	NC_016805	CG	3	6	505	510	0 %	0 %	50 %	50 %	381335654
11	NC_016805	TGA	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335654
12	NC_016805	ATTTA	2	10	549	558	40 %	60 %	0 %	0 %	381335654
13	NC_016805	TGG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335654
14	NC_016805	GC	3	6	630	635	0 %	0 %	50 %	50 %	381335654
15	NC_016805	T	6	6	661	666	0 %	100 %	0 %	0 %	381335654
16	NC_016805	CAG	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335654
17	NC_016805	TTG	2	6	750	755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335654
18	NC_016805	TCTGG	2	10	768	777	0 %	40 %	40 %	20 %	381335654
19	NC_016805	AAG	2	6	792	797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335654
20	NC_016805	TTG	2	6	876	881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335654
21	NC_016805	ATG	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335654
22	NC_016805	ATG	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335654
23	NC_016805	A	6	6	1032	1037	100 %	0 %	0 %	0 %	381335654
24	NC_016805	ATT	2	6	1206	1211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335654
25	NC_016805	TGA	2	6	1225	1230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335654
26	NC_016805	A	6	6	1250	1255	100 %	0 %	0 %	0 %	381335654
27	NC_016805	TGG	2	6	1339	1344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335654
28	NC_016805	TTC	2	6	1354	1359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335654
29	NC_016805	TAC	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335654
30	NC_016805	AG	3	6	1396	1401	50 %	0 %	50 %	0 %	381335654
31	NC_016805	TGA	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335654
32	NC_016805	GT	3	6	1486	1491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016805	AAC	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016805	GTT	2	6	1551	1556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016805	TTA	3	9	1594	1602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016805	CTA	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016805	T	6	6	1613	1618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016805	ATT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016805	CAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335655
40	NC_016805	TTA	2	6	1703	1708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335655
41	NC_016805	ATG	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335655
42	NC_016805	TCA	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335655
43	NC_016805	AAC	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335655
44	NC_016805	ATG	2	6	1787	1792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335655
45	NC_016805	AAC	2	6	1836	1841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335655
46	NC_016805	AATT	2	8	1868	1875	50 %	50 %	0 %	0 %	381335655
47	NC_016805	TGG	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335655
48	NC_016805	TTACC	2	10	1895	1904	20 %	40 %	0 %	40 %	381335655
49	NC_016805	CTTT	2	8	1910	1917	0 %	75 %	0 %	25 %	381335655
50	NC_016805	ATG	2	6	1943	1948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335655
51	NC_016805	CTA	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335655
52	NC_016805	TCA	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335655
53	NC_016805	GAT	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335655
54	NC_016805	CTG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335655
55	NC_016805	ATT	2	6	2101	2106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335655
56	NC_016805	CAAA	2	8	2110	2117	75 %	0 %	0 %	25 %	381335655
57	NC_016805	CAA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335655
58	NC_016805	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335655
59	NC_016805	ACA	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335655
60	NC_016805	AAGC	2	8	2471	2478	50 %	0 %	25 %	25 %	381335655
61	NC_016805	GTT	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335655
62	NC_016805	AAG	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335655
63	NC_016805	GGA	2	6	2637	2642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	381335655
64	NC_016805	GA	3	6	2759	2764	50 %	0 %	50 %	0 %	381335655
65	NC_016805	AAACA	2	10	2869	2878	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016805	TA	3	6	2902	2907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016805	AT	3	6	3000	3005	50 %	50 %	0 %	0 %	381335656
68	NC_016805	CGTA	2	8	3015	3022	25 %	25 %	25 %	25 %	381335656
69	NC_016805	ATT	2	6	3051	3056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335656
70	NC_016805	AGA	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335656
71	NC_016805	ATT	2	6	3070	3075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335656
72	NC_016805	TCA	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335656
73	NC_016805	GGC	2	6	3082	3087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	381335656
74	NC_016805	ATT	2	6	3098	3103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335656
75	NC_016805	TCG	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335656
76	NC_016805	ATG	2	6	3170	3175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335656
77	NC_016805	A	7	7	3280	3286	100 %	0 %	0 %	0 %	381335656
78	NC_016805	CCGT	2	8	3287	3294	0 %	25 %	25 %	50 %	381335656
79	NC_016805	GAT	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335656
80	NC_016805	A	8	8	3367	3374	100 %	0 %	0 %	0 %	381335656
81	NC_016805	TGG	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335656
82	NC_016805	ACAA	2	8	3406	3413	75 %	0 %	0 %	25 %	381335656
83	NC_016805	ATT	2	6	3469	3474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335657
84	NC_016805	TTA	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335657
85	NC_016805	AGT	2	6	3594	3599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335657
86	NC_016805	GCAA	2	8	3620	3627	50 %	0 %	25 %	25 %	381335657
87	NC_016805	AAG	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335657
88	NC_016805	TAA	2	6	3695	3700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335657
89	NC_016805	A	6	6	3705	3710	100 %	0 %	0 %	0 %	381335657
90	NC_016805	ATC	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335657
91	NC_016805	TTTG	2	8	3773	3780	0 %	75 %	25 %	0 %	381335657
92	NC_016805	AGA	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335657
93	NC_016805	TTGTAT	2	12	3864	3875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	381335657
94	NC_016805	AGAA	2	8	3905	3912	75 %	0 %	25 %	0 %	381335657
95	NC_016805	AT	3	6	4103	4108	50 %	50 %	0 %	0 %	381335657
96	NC_016805	CGA	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335657
97	NC_016805	AAT	2	6	4260	4265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335657
98	NC_016805	AACG	2	8	4294	4301	50 %	0 %	25 %	25 %	381335657
99	NC_016805	CAA	2	6	4341	4346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335657
100	NC_016805	GAT	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335657
101	NC_016805	TAT	2	6	4420	4425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335657
102	NC_016805	GT	3	6	4507	4512	0 %	50 %	50 %	0 %	381335657
103	NC_016805	TGA	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016805	ATAG	2	8	4593	4600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016805	TGA	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335658
106	NC_016805	TAT	2	6	4668	4673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335658
107	NC_016805	TGA	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335658
108	NC_016805	GAA	2	6	4684	4689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335658
109	NC_016805	TA	3	6	4792	4797	50 %	50 %	0 %	0 %	381335658
110	NC_016805	CAT	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335658
111	NC_016805	TGA	2	6	4857	4862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335658
112	NC_016805	GAT	2	6	4930	4935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335658
113	NC_016805	CAAA	2	8	4960	4967	75 %	0 %	0 %	25 %	381335658
114	NC_016805	TGG	2	6	5013	5018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335658
115	NC_016805	TGG	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335658
116	NC_016805	CGG	2	6	5031	5036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	381335658
117	NC_016805	TGG	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335658
118	NC_016805	TGT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335658
119	NC_016805	ATA	2	6	5123	5128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335658
120	NC_016805	CA	3	6	5164	5169	50 %	0 %	0 %	50 %	381335658
121	NC_016805	CTGATA	2	12	5231	5242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	381335658
122	NC_016805	ACA	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335658
123	NC_016805	TTG	2	6	5278	5283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335658
124	NC_016805	TAAA	2	8	5309	5316	75 %	25 %	0 %	0 %	381335658
125	NC_016805	AGA	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335658
126	NC_016805	AG	3	6	5364	5369	50 %	0 %	50 %	0 %	381335658
127	NC_016805	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335658
128	NC_016805	GCT	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335658
129	NC_016805	ATG	2	6	5806	5811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335658
130	NC_016805	TTG	2	6	5837	5842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335658
131	NC_016805	AGC	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335658
132	NC_016805	GGT	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335658
133	NC_016805	GAA	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335658
134	NC_016805	TCGC	2	8	6126	6133	0 %	25 %	25 %	50 %	381335658
135	NC_016805	GAT	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335658
136	NC_016805	TTA	3	9	6200	6208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335658
137	NC_016805	ATT	2	6	6258	6263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335658
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398	NC_016805	TTA	2	6	18463	18468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335667
399	NC_016805	TTG	2	6	18537	18542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335667
400	NC_016805	TAT	2	6	18575	18580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335667
401	NC_016805	CAA	2	6	18584	18589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335667
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403	NC_016805	AGC	2	6	18795	18800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335667
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485	NC_016805	A	8	8	22285	22292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_016805	A	7	7	22298	22304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_016805	G	6	6	22316	22321	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_016805	G	6	6	22386	22391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_016805	CGA	2	6	22417	22422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_016805	GGC	2	6	22703	22708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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499	NC_016805	TTAG	2	8	22916	22923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_016805	TGG	2	6	22925	22930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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